北京2025年8月13日 /美通社/ -- 近日,北京積算科技有限公司(以下簡(jiǎn)稱"積算科技")推出一站式AlphaFold3在線算力服務(wù),現(xiàn)已開(kāi)放免費(fèi)使用。其內(nèi)置優(yōu)化后的AlphaFold3模型,支持圖形化界面創(chuàng)建容器、低代碼啟動(dòng)任務(wù),通過(guò)在線服務(wù)讓科研人員繞開(kāi)繁瑣的部署、設(shè)置和調(diào)試,實(shí)現(xiàn)零門(mén)檻使用,以更簡(jiǎn)單、高效的方式完成蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)。
AlphaFold3一經(jīng)發(fā)布就廣受關(guān)注,它利用Transformer、擴(kuò)散模型和進(jìn)化信息多序列比對(duì),不僅能高精度預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),更能預(yù)測(cè)大部分生物分子的結(jié)構(gòu)及其相互作用。與傳統(tǒng)方法相比,在預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)與一些分子的"對(duì)接"方面精度提升高達(dá)50%,在藥物研發(fā)、疾病機(jī)理研究、精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域應(yīng)用廣泛。
AlphaFold3計(jì)算過(guò)程高度復(fù)雜,涉及大規(guī)模MSA、深度特征提取、迭代結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)及優(yōu)化,對(duì)算力平臺(tái)硬件配置要求高:GPU計(jì)算卡需要大容量顯存和高帶寬、計(jì)算節(jié)點(diǎn)大容量?jī)?nèi)存、數(shù)據(jù)存儲(chǔ)容量超700G等。同時(shí)使用門(mén)檻高,在部署和使用過(guò)程中,往往需要通過(guò)命令行直接在操作系統(tǒng)界面進(jìn)行操作,涉及數(shù)十句代碼命令,需要操作人員具備一定的計(jì)算機(jī)編程基礎(chǔ)。如果通過(guò)官方網(wǎng)站使用AlphaFold3,則存在每個(gè)賬戶每天限額20個(gè)任務(wù)、僅夠試錯(cuò)2-3個(gè)靶點(diǎn)、輸入長(zhǎng)度限制等問(wèn)題。
針對(duì)以上問(wèn)題,積算科技在其算力服務(wù)平臺(tái)正式上線AlphaFold3應(yīng)用,為用戶提供高效、易用的在線算力服務(wù)。用戶開(kāi)通服務(wù)后,無(wú)需部署即可在線使用AlphaFold3的全部功能,無(wú)需排隊(duì)等待,支持最大5120AA(氨基酸,amino acid)的輸入,并具有低代碼操作、圖形化容器搭建等特點(diǎn),可大幅提升用戶的使用體驗(yàn)。
積算科技算力服務(wù)平臺(tái)支持圖形化界面、低代碼開(kāi)發(fā),極大地降低了使用門(mén)檻。用戶遠(yuǎn)程登錄平臺(tái)后,通過(guò)圖形化界面快速創(chuàng)建容器環(huán)境,只需要通過(guò)鼠標(biāo)點(diǎn)擊選擇預(yù)置好的鏡像、數(shù)據(jù)集及用戶自行上傳的輸入序列,30秒內(nèi)便可完成預(yù)測(cè)前的所有準(zhǔn)備。之后,用戶只需要進(jìn)入容器,通過(guò)集成好的在線shell界面輸入簡(jiǎn)單的兩句代碼,為AlphaFold3程序指定文件位置,回車(chē)運(yùn)行即可體驗(yàn)強(qiáng)大算力帶來(lái)的高水平運(yùn)算速度。
支撐該算力服務(wù)平臺(tái)的算力系統(tǒng)以高速I(mǎi)nfiniBand計(jì)算網(wǎng)絡(luò)為核心構(gòu)建,配置全閃NVMe SSD共享存儲(chǔ),計(jì)算節(jié)點(diǎn)采用64核處理器核心、1TB大容量?jī)?nèi)存、8張GPU計(jì)算卡,顯存容量超640G,為用戶帶來(lái)極高的性能體驗(yàn),加速結(jié)果生成。此外,平臺(tái)基于容器進(jìn)行算力調(diào)度和資源管理,具備強(qiáng)大的平臺(tái)管理、用戶管理、資源管理等功能,幫助用戶快速完成蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)。
積算科技秉承以客戶為中心的服務(wù)理念,來(lái)自生物、醫(yī)學(xué)、材料學(xué)、計(jì)算機(jī)等不同專業(yè)領(lǐng)域的團(tuán)隊(duì)成員緊密合作,從初期調(diào)研,到軟件安裝,再到作業(yè)測(cè)試,全程提供專業(yè)、可靠的技術(shù)解決方案。此外,積算科技撰寫(xiě)了AlphaFold3使用教程,幫助用戶快速上手。
以740aa_4a5s.json為例,輸出的結(jié)果存放在用戶指定的文件夾。由于AlphaFold3并未集成結(jié)果可視化模塊,待任務(wù)完成后,客戶可將結(jié)果文件夾中的cif及json文件下載,使用pymol或paeViewer等工具進(jìn)行可視化分析。
實(shí)測(cè)結(jié)果圖如下(740aa_4a5s.json):
積算科技誕生于全球生成式AI浪潮,專注于智能算力服務(wù)市場(chǎng),致力于成為中國(guó)最具價(jià)值的智能算力服務(wù)商,聚焦互聯(lián)網(wǎng)、運(yùn)營(yíng)商、高校、新能源汽車(chē)等領(lǐng)域的多家頭部客戶提供算力服務(wù)。公司擁有萬(wàn)卡級(jí)先進(jìn)智能算力資源池,提供裸金屬、智能算力系統(tǒng)、專屬智能算力系統(tǒng)等算力服務(wù)產(chǎn)品,適用于大模型訓(xùn)練與推理、算法研究、大數(shù)據(jù)分析、自動(dòng)駕駛、智能科學(xué)計(jì)算等多元場(chǎng)景。其運(yùn)維和服務(wù)團(tuán)隊(duì)具備大規(guī)模智能算力系統(tǒng)設(shè)計(jì)建設(shè)、大模型開(kāi)發(fā)應(yīng)用及性能優(yōu)化能力,可提供全棧大模型應(yīng)用開(kāi)發(fā)服務(wù)支持,并根據(jù)客戶需求提供靈活服務(wù)模式。